More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1252 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
327 aa  643    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  42.56 
 
 
297 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  41.98 
 
 
305 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.92 
 
 
302 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  43.26 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  37.76 
 
 
297 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  41.99 
 
 
318 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  38.91 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  36.88 
 
 
299 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 
579 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.05 
 
 
316 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.38 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.86 
 
 
300 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  37.84 
 
 
306 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.84 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.45 
 
 
551 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.83 
 
 
301 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  37.41 
 
 
326 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.49 
 
 
602 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  34.29 
 
 
323 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
312 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.58 
 
 
306 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.12 
 
 
302 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  35.02 
 
 
306 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  36 
 
 
308 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
333 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
333 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
333 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  35.59 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  36.54 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  34.46 
 
 
310 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  37.23 
 
 
309 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.35 
 
 
547 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  34.78 
 
 
348 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  34.52 
 
 
550 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.08 
 
 
302 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  35.12 
 
 
308 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.66 
 
 
306 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1021  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
358 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.664925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  36.73 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  35.5 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  36.27 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  34.58 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  34.77 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  35.69 
 
 
318 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
318 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  39.07 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.36 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  33.67 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  38.08 
 
 
327 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  36.08 
 
 
306 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  36.36 
 
 
336 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  33.55 
 
 
310 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  32.9 
 
 
317 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  33.9 
 
 
304 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  36.24 
 
 
331 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.14 
 
 
339 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37.07 
 
 
324 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.8 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  35.66 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  34.12 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  33.79 
 
 
310 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  33.66 
 
 
320 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  35.37 
 
 
320 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  34.8 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  35.91 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3112  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  34.8 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  33.77 
 
 
320 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  33.77 
 
 
320 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  33.77 
 
 
320 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  37.55 
 
 
327 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  33.67 
 
 
309 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  33.89 
 
 
310 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
346 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
348 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  34.88 
 
 
313 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
309 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  35.71 
 
 
313 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  34.92 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  33.66 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  33.11 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  35.48 
 
 
325 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
306 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  33 
 
 
318 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  32.19 
 
 
318 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.97 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  33.87 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  33.55 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  33.11 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  34.74 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  32.24 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  33.11 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  34.47 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>