More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0542 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  64.98 
 
 		 318 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  63.85 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  64.31 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  60.27 
 
 		 297 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  40.89 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.96 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  39.73 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  41.58 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  36.13 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  36.21 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  34.54 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.66 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  34.67 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.21 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  32.9 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  35.43 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  34.1 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.9 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.75 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  33.12 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  33.78 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  32.58 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  31.8 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 		 551 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  31.8 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  31.89 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  35.14 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  33.12 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  32.81 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  33.65 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  31.76 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  30.7 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  32.26 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  35.55 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  34.2 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  36.33 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  31.83 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  31.13 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  32.99 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  31.48 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  32.8 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.55 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  35.71 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  32.7 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  37.13 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  33.01 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  34.1 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  31.69 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  32.34 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.44 
 
 		 579 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  29.68 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.29 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  32.9 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  32.05 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  30 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.89 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  31.8 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  30.45 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  33.88 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  33.01 
 
 		 340 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  30.19 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  30.19 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  30.19 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  31.02 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  34.1 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  32.37 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  32.05 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  30.72 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  32.13 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  32.17 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  32.78 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  31.38 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  31.15 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  31.23 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  34.78 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  33 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  32.8 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  32.59 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  34.13 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  30.07 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  30.87 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  34.31 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  31.15 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  30.13 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  32.01 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>