More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1503 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
292 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.8 
 
 
291 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  47.06 
 
 
297 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  44.67 
 
 
318 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  42.61 
 
 
297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  42.18 
 
 
305 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  42.66 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  37.09 
 
 
306 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  38.91 
 
 
327 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
323 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
306 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
308 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.67 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  31.91 
 
 
409 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  33 
 
 
306 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.54 
 
 
316 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 
302 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  32.33 
 
 
312 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  32.67 
 
 
304 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
326 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.08 
 
 
407 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  30.1 
 
 
306 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.4 
 
 
301 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  35.4 
 
 
319 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
300 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  34.55 
 
 
309 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  34.74 
 
 
304 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  35.29 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  34.55 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  31.75 
 
 
330 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  33.87 
 
 
304 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3112  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 
386 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  32.13 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  34.67 
 
 
310 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 
313 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  31.5 
 
 
329 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.79 
 
 
548 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  35.48 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.45 
 
 
301 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.56 
 
 
302 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  31.25 
 
 
308 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.45 
 
 
579 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  31.02 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  33.82 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  35.04 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  32.67 
 
 
304 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  33 
 
 
395 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.55 
 
 
318 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.68 
 
 
318 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  31.68 
 
 
310 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.22 
 
 
317 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  32.47 
 
 
318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  31.23 
 
 
333 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  31.15 
 
 
339 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  32.69 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  34.77 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.34 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.89 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  32.71 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  31.25 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  33 
 
 
304 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  31.49 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  34.54 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  30.43 
 
 
552 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  29.43 
 
 
299 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  30.92 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  33.7 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  32.97 
 
 
343 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  33.82 
 
 
333 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  33.82 
 
 
333 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  31.88 
 
 
396 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.68 
 
 
402 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  31.03 
 
 
547 aa  132  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  33.82 
 
 
333 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  30.36 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  33.01 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  31.87 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  32.49 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  33.58 
 
 
330 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  31.92 
 
 
308 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  32.28 
 
 
326 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  31.77 
 
 
309 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  34.16 
 
 
326 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
427 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  31.56 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  31.79 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  31.25 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  31.56 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  32.72 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  31.79 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  34.03 
 
 
309 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  30.26 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  30.6 
 
 
335 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  33.22 
 
 
322 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  32.23 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  30.43 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  32.27 
 
 
569 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>