More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1749 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.41 
 
 
287 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2475  Thioredoxin-disulfide reductase  52.58 
 
 
293 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1139  thioredoxin-disulfide reductase  47.37 
 
 
293 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.234557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2663  thioredoxin reductase  48.76 
 
 
286 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2349  thioredoxin reductase  48.76 
 
 
286 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2134  Thioredoxin-disulfide reductase  48.41 
 
 
290 aa  265  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000266585  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  45.58 
 
 
287 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  42.4 
 
 
309 aa  228  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.31 
 
 
287 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  36.67 
 
 
304 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  35.67 
 
 
305 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  35.88 
 
 
297 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.9 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
301 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  34.92 
 
 
318 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.56 
 
 
391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.32 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.66 
 
 
300 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  34.03 
 
 
292 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  31.92 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  31.92 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.67 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  33.89 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  30.36 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  34.32 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  32.57 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  32.81 
 
 
326 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
302 aa  125  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  33.44 
 
 
312 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  33.13 
 
 
321 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  33.13 
 
 
321 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  33.13 
 
 
321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  30.49 
 
 
315 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.22 
 
 
314 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  34.1 
 
 
304 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.37 
 
 
523 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.19 
 
 
316 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 
427 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 
579 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  33.55 
 
 
320 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  31.49 
 
 
318 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  32.15 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  32.5 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  32.5 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  32.5 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  32.5 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  32.81 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  35.79 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  32.89 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.1 
 
 
548 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  33.01 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  31.15 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  32.48 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  32.2 
 
 
320 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  32.2 
 
 
320 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  32.8 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  33.22 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  31.96 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  32.5 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.89 
 
 
326 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  33.66 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  32.01 
 
 
510 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  32.11 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 
291 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  30.89 
 
 
314 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  32.27 
 
 
320 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  32.27 
 
 
320 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  32.44 
 
 
319 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  32.27 
 
 
320 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  31.17 
 
 
332 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  32.27 
 
 
320 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  27.79 
 
 
560 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.22 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  31.79 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  30.69 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  29.45 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  28.38 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  29.43 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  31.54 
 
 
297 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  31.43 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  32.05 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  30.79 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  31.79 
 
 
309 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  29.04 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  30.99 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  30.45 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  30.45 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  30.45 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  30.99 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  33.01 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  29.58 
 
 
550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  31.92 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  29.56 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  31.68 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  30.67 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  34.23 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  31.68 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  29.64 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>