More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2752 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  81.5 
 
 
214 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  81.5 
 
 
212 aa  349  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  81.91 
 
 
209 aa  348  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  81 
 
 
214 aa  347  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  81.91 
 
 
209 aa  347  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  79.1 
 
 
209 aa  347  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  81.91 
 
 
209 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  81 
 
 
214 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  82.41 
 
 
209 aa  346  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  81.41 
 
 
209 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  80.3 
 
 
204 aa  343  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  78.5 
 
 
209 aa  340  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  78.5 
 
 
204 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  78.89 
 
 
218 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  75.49 
 
 
204 aa  331  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  52.79 
 
 
203 aa  198  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  44.72 
 
 
235 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  39.64 
 
 
571 aa  141  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.34 
 
 
550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.85 
 
 
550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  39.44 
 
 
545 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.98 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  44.04 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  30.65 
 
 
241 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.56 
 
 
261 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  31.18 
 
 
240 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.63 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.06 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  41.35 
 
 
182 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  38.57 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  42.86 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  34.48 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0817  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.84 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  40.29 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  45.87 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.36 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  40.5 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  41.53 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  42.59 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  40.91 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.46 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.59 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  47.79 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  42.59 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  34.08 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00030  maltose O-acetyltransferase, putative  40.91 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  40.68 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  46.49 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  38.93 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  38.93 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  47.19 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  35.47 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  46.07 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.33 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  34.42 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  35.77 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  32.14 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.43 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.17 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  42.2 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1810  hypothetical protein  36.31 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  30.37 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1559  hypothetical protein  29.47 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0111619  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  39.32 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  42.34 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  34.38 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  40.54 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  40.19 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.77 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  41.59 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  43.64 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  31.36 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  42.99 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  42.2 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1501  galactoside O-acetyltransferase  40.83 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  38.18 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  38.97 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.98 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  42.73 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7377  acetyltransferase, putative  33.93 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00823618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  42.73 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  40 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  40.83 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.96 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.59 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2637  hexapaptide repeat-containing transferase  33.73 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  34.59 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>