More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3152 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  100 
 
 
209 aa  433  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  94.26 
 
 
209 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  93.3 
 
 
209 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  93.3 
 
 
209 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  89.47 
 
 
209 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  88.67 
 
 
214 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  87.68 
 
 
214 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  88.18 
 
 
214 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  88.18 
 
 
212 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  81.82 
 
 
209 aa  361  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  83.08 
 
 
204 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  81.91 
 
 
204 aa  348  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  78.95 
 
 
209 aa  344  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  81.5 
 
 
218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  80 
 
 
204 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  75.38 
 
 
204 aa  320  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  48.5 
 
 
235 aa  205  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  50.5 
 
 
203 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  43.37 
 
 
571 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.41 
 
 
550 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.87 
 
 
550 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  38.33 
 
 
545 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  35.63 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  43.24 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  47.83 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.26 
 
 
231 aa  84.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  42.86 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  41.32 
 
 
183 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  50 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.46 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  48.67 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.77 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  34.9 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  45.45 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.06 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  44.95 
 
 
181 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.98 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  48.91 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  45.37 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  37.23 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  45.87 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  43.22 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  42.73 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1950  galactoside O-acetyltransferase  30.59 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.23 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  45.37 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  41.38 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3378  galactoside O-acetyltransferase  30.59 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3268e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.67 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  35.53 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  44.44 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  35.12 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  39.26 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  38.67 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0817  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.65 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  43.52 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  43.52 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2050  galactoside O-acetyltransferase  31.76 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.120347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  42.59 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  31.9 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  44.04 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  43.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  43.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  44.21 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  36.5 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  39.69 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2028  O-acetyltransferase, putative  30 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  39.69 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  30.21 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.91 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  43.12 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.87 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  43.24 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  32.26 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  45.79 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  44.86 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  43.48 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.17 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  29.17 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  40.91 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  43.1 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  30.86 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.76 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  32.95 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  37.41 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  43.22 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  42.98 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  41.53 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  39.82 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  45.22 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1501  galactoside O-acetyltransferase  32.45 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.53 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  45.22 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>