More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1439 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  82.76 
 
 
204 aa  358  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  79.41 
 
 
209 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  79.8 
 
 
209 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  82 
 
 
209 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  81.5 
 
 
209 aa  337  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  81.5 
 
 
209 aa  337  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  80 
 
 
214 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  80.2 
 
 
209 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  79.5 
 
 
212 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  79.5 
 
 
214 aa  334  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  78.89 
 
 
204 aa  333  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  79 
 
 
214 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  78.54 
 
 
209 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  77.45 
 
 
204 aa  331  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  70.44 
 
 
204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  46.67 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  52.02 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  37.95 
 
 
571 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.85 
 
 
550 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.82 
 
 
550 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  35.16 
 
 
545 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  36.52 
 
 
240 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0817  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.51 
 
 
261 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  43.12 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  46.79 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  45.05 
 
 
195 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.91 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  42.28 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  42.86 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  44.55 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  48.96 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  40.29 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  40.87 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.81 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  39.17 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  50 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  39.06 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1780  acetyltransferase  31.82 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  34.67 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  38.85 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.77 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  43.12 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  44.14 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  42.59 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.82 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  34.06 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  34.88 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  40.91 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  43.22 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.64 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  43.36 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.25 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.36 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  30.81 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.51 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  46.9 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  30.58 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  29.58 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4095  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.25 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.977021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  42.98 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.11 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  29.58 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3168  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  32.43 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  46.3 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  29.58 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  42.73 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  40.54 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.13 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  38.06 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.11 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  41.23 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  41.23 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  39.09 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  29.11 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  35.77 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  38.26 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.11 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  45.05 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  46.09 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.23 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  41.23 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  30.05 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  42.57 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_006686  CND00030  maltose O-acetyltransferase, putative  38.64 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4251  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.41 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  41.23 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1559  hypothetical protein  27.46 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0111619  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  42.5 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  32.45 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  39.32 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>