More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1346 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  98.56 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  94.26 
 
 		 209 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  93.3 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  92.57 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  89.47 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  91.09 
 
 		 214 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  90.59 
 
 		 214 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  90.15 
 
 		 212 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  80.38 
 
 		 209 aa  357  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  82.59 
 
 		 204 aa  352  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  81.91 
 
 		 204 aa  347  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  77.51 
 
 		 209 aa  344  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  79.5 
 
 		 204 aa  339  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  81.5 
 
 		 218 aa  337  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  75.38 
 
 		 204 aa  324  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  46 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  50.5 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  42.77 
 
 		 571 aa  141  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.41 
 
 		 550 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.9 
 
 		 550 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  39.23 
 
 		 545 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  44.14 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.19 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  34.86 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  37.42 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  44.55 
 
 		 187 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  40.87 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  47.32 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.81 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.23 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  45.87 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.68 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  49.56 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  41.07 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  38.52 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  46.74 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.23 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  37.23 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.77 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  47.79 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  31.02 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  39.72 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  42.37 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  32.72 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  43.12 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.74 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.91 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  40.91 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  38.84 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  38.12 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  42.99 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.06 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  32.89 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.87 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  33.55 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  43.52 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  41.74 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  43.93 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  41.12 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  41.12 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  36.67 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  39.69 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  41.12 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  42.11 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  41.12 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  39.69 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  39.81 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.77 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.06 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  41.67 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  32 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.4 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  37.98 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  40 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0817  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.28 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.85 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.12 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1950  galactoside O-acetyltransferase  29.41 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  42.34 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  39.66 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  46.67 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0832  Isoleucine patch superfamily acetyltransferase  48.86 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  40.37 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  42.06 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.45 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  41.67 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  41.27 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1501  galactoside O-acetyltransferase  31.38 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  40.35 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>