More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7339 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  100 
 
 
545 aa  1115    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.59 
 
 
550 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.21 
 
 
550 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  38.88 
 
 
571 aa  347  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  36.96 
 
 
235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  39.44 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 
209 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  39.78 
 
 
209 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  38.33 
 
 
209 aa  106  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 
209 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  40.62 
 
 
204 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  38.67 
 
 
212 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  43.61 
 
 
209 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  37.16 
 
 
203 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  38.67 
 
 
214 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.12 
 
 
214 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  42.73 
 
 
212 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  38.12 
 
 
214 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  36.97 
 
 
204 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  38.67 
 
 
209 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  35.59 
 
 
209 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  38.79 
 
 
209 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
218 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  36.51 
 
 
204 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.15 
 
 
181 aa  100  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1810  hypothetical protein  48.28 
 
 
183 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  44.14 
 
 
178 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  42.73 
 
 
205 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  41.67 
 
 
187 aa  93.6  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  34.73 
 
 
232 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.36 
 
 
214 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  47 
 
 
231 aa  90.1  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.69 
 
 
241 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.97 
 
 
179 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  41.74 
 
 
240 aa  88.2  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0940  acetyltransferase  38.6 
 
 
181 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.750437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0957  acetyltransferase  38.6 
 
 
181 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  32.92 
 
 
241 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2454  hypothetical protein  36.42 
 
 
202 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0406418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2976  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  35.4 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  35.54 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  35.54 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  43.27 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
240 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  30.57 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  46.3 
 
 
175 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.36 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0561  putative acetyltransferase  45 
 
 
166 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0124634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  37.4 
 
 
177 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  31.48 
 
 
233 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  43.97 
 
 
207 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  43.97 
 
 
207 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 
186 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  41.32 
 
 
177 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  39.83 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  29.75 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.74 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1500  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.04 
 
 
179 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
231 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  32.75 
 
 
231 aa  80.1  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  38.93 
 
 
170 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  31.64 
 
 
229 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  33.99 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  34.25 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4711  galactoside O-acetyltransferase  37.78 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.410287  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  34.53 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  30.65 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  30.43 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.03 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  35.58 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.02096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  31.75 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  37.17 
 
 
174 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7377  acetyltransferase, putative  40.87 
 
 
195 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00823618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  29.66 
 
 
232 aa  77  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  36.61 
 
 
176 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5875  chloramphenicol acetyltransferase  40.32 
 
 
200 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0086312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.75 
 
 
248 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  39.47 
 
 
199 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  27.5 
 
 
240 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  41.59 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  40.71 
 
 
213 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
193 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  36.09 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  33.67 
 
 
278 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.13 
 
 
244 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  39.39 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1559  hypothetical protein  30.07 
 
 
224 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0111619  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.94 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  56.9 
 
 
220 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.61 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  41.59 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  39.47 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  41.59 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.2 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1501  galactoside O-acetyltransferase  36 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  35.14 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>