More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1810 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1810  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  362  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210295 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.67 
 
 
550 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.83 
 
 
550 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  48.28 
 
 
545 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4416  putative acetyltransferase protein  40 
 
 
146 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  44.44 
 
 
235 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.58 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  46.88 
 
 
231 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2643  hexapaptide repeat-containing transferase  39.22 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1559  hypothetical protein  28.85 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0111619  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  35.19 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.07 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  32.34 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.95 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  31.25 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  31.25 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  31.25 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  37.58 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  31.87 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1501  galactoside O-acetyltransferase  30.41 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13050  transferase  31.87 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.59 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  36.76 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  38.6 
 
 
571 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  35.03 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  31.25 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1901  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.95 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.99 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  35.56 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  35.67 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  35.62 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3264  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  31.39 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.18 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.62 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.09 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.14 
 
 
212 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 
209 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  33.97 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  32.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  35.45 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11077  sugar O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03380)  35.34 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  31.14 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.55 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  34.39 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  32.56 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 
209 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  32.93 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2926  hypothetical protein  30.34 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1624  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.15 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  33.97 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.5 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.51 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0954  maltose O-acetyltransferase  38.26 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.186778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  36.61 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  29.88 
 
 
278 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3676  acetyltransferase  32.78 
 
 
208 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  38.39 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  39.81 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000791  acetyltransferase  37.5 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1500  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  29.94 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  37.7 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0760  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0159145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  37.69 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1515  maltose O-acetyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00228608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  52.24 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.93 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  28.99 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0592  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  28.09 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2046  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.29 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06688  acetyltransferase  35 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  52.24 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7377  acetyltransferase, putative  34.29 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00823618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  26.7 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.09 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  49.25 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  32.12 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  36.84 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0723  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.77 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.09 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0439  putative sugar acetyltransferase  30.5 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.627014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  35.09 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  48.65 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3688  acetyltransferase  38.3 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.38 
 
 
200 aa  62.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  36.29 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2619  hexapaptide repeat-containing transferase  31.76 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.14 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1843  acetyltransferase  32.65 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  31.79 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  35.76 
 
 
233 aa  61.6  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>