More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2350 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  52.79 
 
 
204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  52.82 
 
 
209 aa  218  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  54.36 
 
 
204 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  52.28 
 
 
209 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  51.98 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  52.02 
 
 
218 aa  214  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  51.79 
 
 
204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  50.5 
 
 
209 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  50.5 
 
 
209 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  50.5 
 
 
209 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  52.82 
 
 
214 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  52.24 
 
 
209 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  52.82 
 
 
212 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.31 
 
 
214 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  51.28 
 
 
209 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  51.79 
 
 
214 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  39 
 
 
235 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.42 
 
 
571 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  32.82 
 
 
545 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.68 
 
 
550 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.3 
 
 
231 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  42.98 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.26 
 
 
550 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  39.29 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  47.92 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.79 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0954  maltose O-acetyltransferase  41.43 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.186778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5196  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  39.47 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1810  hypothetical protein  35.56 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  45.13 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  45.13 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  34.83 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  34.83 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  36.88 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1531  hexapaptide repeat-containing transferase  42.98 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000154529  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  39.64 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  36.57 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  35.16 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0300  hypothetical protein  39.06 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  41.44 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  38.26 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  37.84 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  31.03 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.39 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  37.27 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  36.36 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.02 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.59 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.21 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  39.47 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  39.47 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  43.9 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06688  acetyltransferase  35.77 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1515  maltose O-acetyltransferase  32.46 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00228608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  40.37 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.68 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  34.48 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.98 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0257  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.14 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  37.39 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  38.94 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  45.16 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000791  acetyltransferase  35.04 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.07 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  38.94 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  45.56 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  38.46 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  43.01 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.39 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.68 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1611  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.04 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  32.12 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.02096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.33 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1126  galactoside-O-acetyltransferase  35.96 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  41.94 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.2 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  60.38 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  33.53 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  30.89 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  36.92 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.09 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  39.09 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  32.94 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.65 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  32.41 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  29.89 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.56 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  37.72 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  38.95 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  34.33 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  36.84 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>