More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3508 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  62.84 
 
 
184 aa  246  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  62.84 
 
 
184 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  62.84 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  62.3 
 
 
184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2974  hexapaptide repeat-containing transferase  59.78 
 
 
180 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  41.34 
 
 
197 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  38.42 
 
 
184 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  42.22 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  39.68 
 
 
216 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  43.26 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  43.58 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  44.75 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  44.69 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  42.31 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  44.2 
 
 
188 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  39.67 
 
 
184 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  43.26 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  43.65 
 
 
188 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  44.69 
 
 
183 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  41.3 
 
 
187 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0665  maltose O-acetyltransferase  43.62 
 
 
206 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  43.68 
 
 
183 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.01 
 
 
187 aa  141  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  41.9 
 
 
185 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  47.4 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  44 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.5 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  44 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  41.9 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  38.46 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  44.57 
 
 
183 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  41.24 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.22 
 
 
193 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  41.34 
 
 
186 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0532  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0502164  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  40.22 
 
 
186 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  39.44 
 
 
197 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0516  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000205896  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  39.44 
 
 
192 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  53.28 
 
 
179 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  39.56 
 
 
196 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1126  galactoside-O-acetyltransferase  37.7 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0575  maltose O-acetyltransferase  41.01 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00855967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0522  maltose O-acetyltransferase  41.01 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00115683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.79 
 
 
190 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00030  maltose O-acetyltransferase, putative  36.79 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  41.24 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.67 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1750  hexapaptide repeat-containing transferase  40.34 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410351  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  42.05 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1396  maltose O-acetyltransferase  39.11 
 
 
187 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000138737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  42.33 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  131  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  35.79 
 
 
199 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  35.79 
 
 
199 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4442  maltose O-acetyltransferase  41.01 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.260239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.92 
 
 
183 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0483  maltose O-acetyltransferase  38.76 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1730  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.33 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  35.33 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  38.89 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  40.45 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2617  hexapaptide repeat-containing transferase  39.33 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  39.55 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.2 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  39.66 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2730  hexapaptide repeat-containing transferase  39.33 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  37.84 
 
 
192 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4251  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.89 
 
 
182 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2655  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.33 
 
 
194 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2294  hexapaptide repeat-containing transferase  37.7 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0503645  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1011  acetyltransferase  40.22 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0285362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2515  hexapaptide repeat-containing transferase  40.59 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323366  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2125  putative sugar acetyltransferase  46.22 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  41.36 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  39.44 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0549  maltose O-acetyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  37.85 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  42.59 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2484  hexapaptide repeat-containing transferase  38.04 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.754666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2366  maltose O-acetyltransferase  38.25 
 
 
187 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00399682  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05940  Maltose O-acetyltransferase  36.36 
 
 
213 aa  124  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  34.43 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.54 
 
 
200 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>