More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02346 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  100 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  36.97 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  37.41 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  38.67 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.05 
 
 		 195 aa  94.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  37.91 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.71 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  37.76 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  40.79 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  40.44 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  36.14 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  40.91 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  41.26 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1880  acetyltransferase  42.62 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  40 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.94 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  38.66 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  35.71 
 
 		 192 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  38.66 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  40.17 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  38.98 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  41.67 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  38.06 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0767  nodulation protein L  37.41 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.55437  hitchhiker  0.000000843349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  34.29 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  40.14 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  41.23 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.88 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  44.55 
 
 		 244 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.54 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  36.88 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.22 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  34.93 
 
 		 185 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  42.42 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  35.62 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.82 
 
 		 550 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  37.68 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  38.1 
 
 		 216 aa  84.3  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.09 
 
 		 187 aa  84  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  38.73 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  33.11 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  42.98 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  36.6 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  35.25 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  36.43 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.25 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3430  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  40.16 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  38.62 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  37.09 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  36.6 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  37.4 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  37.4 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  37.33 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00030  maltose O-acetyltransferase, putative  38.76 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  37.33 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  37.33 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  40.91 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  38.73 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  37.86 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  36.5 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5448  hexapaptide repeat-containing transferase  32.32 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.848437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18690  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  41.04 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  34.23 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4917  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  42.06 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  39.37 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  39.02 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1426  nodulation protein L, putative  40.91 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  35.53 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  39.86 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4442  maltose O-acetyltransferase  43.86 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.260239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  35.95 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  32.85 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  32.85 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0549  maltose O-acetyltransferase  42.98 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  33.55 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  46.81 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  40.71 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  39.86 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  39.2 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  37.59 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  33.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  42.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  38.93 
 
 		 545 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  32.1 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  67.27 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  33.55 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  34.13 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  42.11 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>