More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0116 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 211 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  75.24 
 
 		 211 aa  347  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  69.12 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  71.22 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  69.27 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  62.32 
 
 		 208 aa  284  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  61.95 
 
 		 210 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  68.72 
 
 		 211 aa  277  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  59.05 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  63.73 
 
 		 218 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  74.43 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  52.07 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  50.69 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  49.77 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  50.25 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 226 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4802  chloramphenicol acetyltransferase  71.81 
 
 		 294 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  46.8 
 
 		 226 aa  192  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  46.94 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  44.08 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  43.01 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  44.93 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  42.49 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  44.55 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  44.93 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  46.28 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  43.52 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  45.26 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  45.36 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  41.88 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  44.95 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  44.95 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  42.63 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.43 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  45.36 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  42.42 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  44.44 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  44.33 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.3 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  40.86 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  41.84 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  41.75 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  43.28 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  41.75 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  42.78 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  40.8 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  39.25 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  40.29 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  38.69 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  42.56 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  39.81 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.86 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  37.86 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  37.44 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  36.97 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  38.35 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  43.3 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  42.63 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  36.89 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  38.89 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  38.58 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  35.5 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.5 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  38.5 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  37.56 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  35.68 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.5 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  41.05 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  44.76 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  45.14 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  44.44 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  43.75 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  43.75 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  41.76 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  39.8 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  44.44 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.75 
 
 		 185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.5 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  44.14 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  44.14 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  43.51 
 
 		 167 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  44.38 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  41.76 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  42.28 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  35.05 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  34.54 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  34.54 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  40.26 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0749  chloramphenicol acetyltransferase  43.71 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.408816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  40.27 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0786  chloramphenicol acetyltransferase  38.95 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  40.4 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0826  chloramphenicol acetyltransferase  38.42 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  0.229885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  46.67 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  39.86 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  47.41 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>