282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2182 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2134  lysine decarboxylase  99.78 
 
 		 460 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2182  lysine decarboxylase  100 
 
 		 460 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.198287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  27.05 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5308  Lysine decarboxylase  27.31 
 
 		 958 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  27.4 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12551  amino acid decarboxylase  27.48 
 
 		 947 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0500695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.49 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1585  arginine decarboxylase  26.04 
 
 		 947 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.02 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.2 
 
 		 493 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.2 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.34 
 
 		 486 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.03 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.03 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  24.74 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  24.74 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  24.74 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  24.74 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  24.74 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  24.74 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  24.74 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.39 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  26.35 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  22.87 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.85 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  25 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.48 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.3 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  23.16 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  24.34 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  24.01 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.7 
 
 		 488 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.58 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.06 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.49 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.55 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2967  ornithine decarboxylase  25.41 
 
 		 757 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.482503  normal  0.818361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2365  biodegradative arginine decarboxylase protein  25.9 
 
 		 759 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0493181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.66 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  31.1 
 
 		 749 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  23.64 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  23.64 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0640  ornithine decarboxylase  27.24 
 
 		 785 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2754  ornithine decarboxylase  25.99 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1821  lysine decarboxylase  25.64 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2437  lysine decarboxylase  25.64 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0716187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2479  lysine decarboxylase  25.93 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2432  lysine decarboxylase  25.64 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0158753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2345  lysine decarboxylase  25.93 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964996  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2074  response regulator receiver domain-containing protein  29.21 
 
 		 766 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0189662  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.08 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3701  lysine decarboxylase  29.38 
 
 		 780 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0757971  normal  0.27436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0861  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.58 
 
 		 759 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3377  ornithine decarboxylase protein  26.58 
 
 		 785 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0715  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1216  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  22.97 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2298  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2988  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1058  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1064  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1611  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.35 
 
 		 759 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2174  Lysine decarboxylase  25.57 
 
 		 759 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0762291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4861  lysine decarboxylase  29.67 
 
 		 779 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112463  hitchhiker  0.00183644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.28 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2578  Lysine decarboxylase  25.57 
 
 		 759 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.181221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5763  lysine decarboxylase  25.69 
 
 		 759 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.318981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0779  arginine decarboxylase  29.38 
 
 		 779 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0975108  normal  0.0520497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6447  lysine decarboxylase  29.45 
 
 		 771 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4356  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 794 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.23 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4010  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 794 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.622198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0862  lysine decarboxylase  25.64 
 
 		 759 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.774343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1020  Lysine decarboxylase  24.88 
 
 		 761 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0689  ornithine decarboxylase  25.06 
 
 		 756 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3477  ornithine decarboxylase  25.41 
 
 		 761 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3514  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 766 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0354739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4345  lysine decarboxylase  29.38 
 
 		 779 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913675  hitchhiker  0.000705117 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0651  lysine decarboxylase  25.12 
 
 		 755 aa  97.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2106  ornithine decarboxylase  26.21 
 
 		 747 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.543581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1590  Lysine decarboxylase  24.24 
 
 		 747 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.334363  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1204  Lysine decarboxylase  24.88 
 
 		 755 aa  97.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000345453  normal  0.552697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.23 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  31.87 
 
 		 751 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0928  ornithine decarboxylase  26.81 
 
 		 785 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335055  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.43 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  30.87 
 
 		 757 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  31.87 
 
 		 751 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  31.17 
 
 		 751 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1088  Lysine decarboxylase  25.41 
 
 		 753 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  26.2 
 
 		 767 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.09 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4822  lysine decarboxylase  29.26 
 
 		 761 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.95 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.54 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0915  lysine decarboxylase  23.93 
 
 		 746 aa  93.2  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1059  ornithine decarboxylase  23.93 
 
 		 746 aa  93.2  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1886  lysine decarboxylase  23.6 
 
 		 751 aa  93.2  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>