More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3976 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 		 487 aa  998    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  57.61 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  44.56 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  45.08 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  43.03 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.09 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  43.47 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.36 
 
 		 488 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  43.27 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.59 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.45 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  41.8 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  40.04 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  42.68 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  40.04 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.84 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  40.25 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  40.04 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  40.04 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  40.04 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  40.04 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.63 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  40.04 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  39.63 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.63 
 
 		 490 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.47 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  42.32 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.94 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  41.41 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  39.26 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.63 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.43 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  37.13 
 
 		 542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  41.77 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.76 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.11 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.7 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.8 
 
 		 485 aa  328  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  36.42 
 
 		 484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.68 
 
 		 474 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.05 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  36.42 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.73 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.62 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.93 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  33.26 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.47 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.47 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.02 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.27 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.66 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.92 
 
 		 494 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.31 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.21 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.5 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  36.05 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  33.33 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.64 
 
 		 473 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  32.37 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  32.37 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.99 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  32.43 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.64 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.44 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  32.01 
 
 		 473 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.02 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.3 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.78 
 
 		 472 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  31.35 
 
 		 524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.66 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.87 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.87 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.91 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.64 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.35 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.13 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.84 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  26.52 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  27.13 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  27.64 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.11 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.41 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  26.93 
 
 		 749 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3477  ornithine decarboxylase  26.25 
 
 		 761 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  26.61 
 
 		 749 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1020  Lysine decarboxylase  26.25 
 
 		 761 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5196  lysine decarboxylase  26.68 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2491  lysine decarboxylase  27.13 
 
 		 712 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2967  ornithine decarboxylase  25.65 
 
 		 757 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.482503  normal  0.818361 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.05 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  26.93 
 
 		 757 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.05 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  26.34 
 
 		 751 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1088  Lysine decarboxylase  26.08 
 
 		 753 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  26.52 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.05 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1590  Lysine decarboxylase  26.51 
 
 		 747 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.334363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2068  lysine decarboxylase  26.52 
 
 		 747 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.014755  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2658  lysine decarboxylase, inducible  26.37 
 
 		 733 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>