215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11911 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  90.93 
 
 
463 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  94.84 
 
 
465 aa  860    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  73.92 
 
 
465 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  100 
 
 
465 aa  941    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  43.1 
 
 
466 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  43.75 
 
 
471 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.02 
 
 
465 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  40.73 
 
 
468 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.42 
 
 
464 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.64 
 
 
464 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.31 
 
 
491 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.09 
 
 
491 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.09 
 
 
490 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.27 
 
 
486 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  29.89 
 
 
489 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  30.99 
 
 
488 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.5 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.4 
 
 
491 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.8 
 
 
473 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.84 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  28.92 
 
 
490 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.7 
 
 
509 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  28.7 
 
 
493 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  28.7 
 
 
493 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  28.7 
 
 
490 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  28.7 
 
 
493 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  28.7 
 
 
493 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.84 
 
 
474 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.77 
 
 
490 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.33 
 
 
490 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  28.7 
 
 
493 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.51 
 
 
482 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  28.48 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  28.48 
 
 
536 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.96 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.22 
 
 
495 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.63 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.11 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.95 
 
 
493 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.29 
 
 
509 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.41 
 
 
488 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  27.01 
 
 
499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  35.98 
 
 
542 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.94 
 
 
508 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.11 
 
 
500 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.6 
 
 
472 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.35 
 
 
494 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  26.24 
 
 
485 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  26.77 
 
 
473 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  26.77 
 
 
473 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  26.77 
 
 
473 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.77 
 
 
473 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  26.77 
 
 
473 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.3 
 
 
483 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  26.52 
 
 
483 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.22 
 
 
486 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.79 
 
 
473 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.25 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.17 
 
 
473 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.01 
 
 
485 aa  148  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.32 
 
 
473 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.91 
 
 
495 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  26.32 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  25.54 
 
 
486 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.15 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.15 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.57 
 
 
483 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.51 
 
 
485 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.49 
 
 
477 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.52 
 
 
445 aa  140  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.57 
 
 
484 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.82 
 
 
484 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.51 
 
 
445 aa  136  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.65 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.65 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  28.54 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.41 
 
 
472 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.06 
 
 
484 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.05 
 
 
498 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.58 
 
 
466 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.46 
 
 
501 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  26.29 
 
 
524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.99 
 
 
440 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  23.74 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  23.74 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  23.74 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25 
 
 
487 aa  117  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.04 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.95 
 
 
476 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.73 
 
 
476 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1204  Lysine decarboxylase  22.09 
 
 
755 aa  75.1  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000345453  normal  0.552697 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0651  lysine decarboxylase  22.29 
 
 
755 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2658  lysine decarboxylase, inducible  20.37 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2106  ornithine decarboxylase  20.36 
 
 
747 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.543581  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002189  lysine decarboxylase  20.16 
 
 
711 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000318347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1925  ornithine decarboxylase  22.68 
 
 
753 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2491  lysine decarboxylase  20.29 
 
 
712 aa  67.8  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00205  lysine decarboxylase  20.16 
 
 
724 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0689  ornithine decarboxylase  21 
 
 
756 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>