More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0052 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  100 
 
 		 473 aa  964    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  43.5 
 
 		 495 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.24 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  42.07 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.89 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  43.31 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.71 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.32 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.61 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.41 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.45 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  38.64 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.24 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  38.85 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.85 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  38.85 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  38.45 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  39.07 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  38.85 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  38.24 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  38.85 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  41.51 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  41.74 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  38.64 
 
 		 493 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.64 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.94 
 
 		 491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.72 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.5 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.78 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.66 
 
 		 488 aa  342  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  40.3 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  40.09 
 
 		 484 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.31 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.42 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.49 
 
 		 485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.83 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  38.46 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  35.21 
 
 		 489 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.77 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  33.46 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.54 
 
 		 509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.46 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.78 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.78 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  36.08 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.19 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.63 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.57 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.72 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.88 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.98 
 
 		 495 aa  289  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.73 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.32 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  36.05 
 
 		 473 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  36.05 
 
 		 473 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  36.05 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  35.84 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  35.84 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  35.84 
 
 		 473 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.55 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  35.84 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.41 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.62 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  35.37 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  35.06 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.05 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.47 
 
 		 476 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.57 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.84 
 
 		 472 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.67 
 
 		 473 aa  239  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  30.49 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.94 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.5 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.98 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.92 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.92 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  28.67 
 
 		 468 aa  202  9e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  31.65 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.79 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.98 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.66 
 
 		 466 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.9 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  31.21 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.8 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  27.89 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.69 
 
 		 465 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.52 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.18 
 
 		 487 aa  159  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  25.48 
 
 		 749 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.46 
 
 		 751 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  24.87 
 
 		 757 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  24.69 
 
 		 751 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  26.26 
 
 		 767 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  24.53 
 
 		 749 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.79 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0715  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.55 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1216  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.55 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0861  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.89 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1611  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.55 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1064  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.55 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>