More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0024 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  76.91 
 
 
473 aa  769    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  76.69 
 
 
473 aa  766    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  77.33 
 
 
473 aa  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  77.33 
 
 
473 aa  774    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  76.27 
 
 
473 aa  756    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  77.12 
 
 
473 aa  765    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  77.54 
 
 
473 aa  776    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  76.69 
 
 
473 aa  766    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 
472 aa  976    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  76.91 
 
 
473 aa  766    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  76.69 
 
 
473 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  51.47 
 
 
478 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  46.88 
 
 
477 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  34.9 
 
 
488 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.19 
 
 
488 aa  272  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.32 
 
 
484 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  33.61 
 
 
485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.52 
 
 
485 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  33.61 
 
 
499 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.05 
 
 
473 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  36.8 
 
 
476 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 
491 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.54 
 
 
491 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.85 
 
 
495 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.48 
 
 
490 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.67 
 
 
508 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  35.93 
 
 
476 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.26 
 
 
482 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.42 
 
 
490 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.12 
 
 
490 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  33.33 
 
 
490 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 
493 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  33.19 
 
 
490 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  33.55 
 
 
490 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.26 
 
 
509 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  33.12 
 
 
493 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  33.33 
 
 
493 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.02 
 
 
487 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  33.33 
 
 
493 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  33.33 
 
 
493 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.3 
 
 
486 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.49 
 
 
490 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  32.76 
 
 
536 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.97 
 
 
474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.3 
 
 
491 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.9 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.92 
 
 
488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.66 
 
 
509 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  29.98 
 
 
542 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  32.34 
 
 
486 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.7 
 
 
485 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.92 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.92 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  33.05 
 
 
484 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.84 
 
 
484 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.86 
 
 
500 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  34.42 
 
 
469 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.79 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  32.15 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.26 
 
 
495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.84 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.1 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.34 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.22 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.22 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.02 
 
 
484 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  28.54 
 
 
483 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.9 
 
 
484 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.39 
 
 
473 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.06 
 
 
472 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.31 
 
 
479 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.42 
 
 
486 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.73 
 
 
466 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.43 
 
 
501 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.97 
 
 
466 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  28.34 
 
 
524 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.61 
 
 
487 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.48 
 
 
498 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  28.74 
 
 
445 aa  156  8e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.41 
 
 
465 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  29.07 
 
 
468 aa  149  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.6 
 
 
465 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  28.12 
 
 
471 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.88 
 
 
465 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.17 
 
 
465 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.07 
 
 
464 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  28.12 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.07 
 
 
464 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.46 
 
 
464 aa  126  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.41 
 
 
440 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  25 
 
 
751 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2068  lysine decarboxylase  25.71 
 
 
747 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.014755  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  25.31 
 
 
751 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2801  lysine decarboxylase, constitutive  22.58 
 
 
714 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2822  lysine decarboxylase, constitutive  22.58 
 
 
714 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2935  lysine decarboxylase, constitutive  22.58 
 
 
714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2718  lysine decarboxylase, constitutive  22.58 
 
 
714 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2760  lysine decarboxylase, constitutive  22.58 
 
 
714 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3767  lysine decarboxylase  22.64 
 
 
713 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00012661  normal  0.0717066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>