293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4595 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 
501 aa  981    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  46.95 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  48.07 
 
 
498 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.14 
 
 
493 aa  346  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.78 
 
 
495 aa  342  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.53 
 
 
491 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.53 
 
 
491 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.54 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.86 
 
 
486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  38.89 
 
 
499 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.85 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.76 
 
 
490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.6 
 
 
484 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.45 
 
 
491 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34 
 
 
490 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  36.55 
 
 
486 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  36.96 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.36 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.45 
 
 
482 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.72 
 
 
509 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  36.91 
 
 
489 aa  297  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.02 
 
 
487 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.47 
 
 
508 aa  293  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.38 
 
 
490 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  32.06 
 
 
490 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  32.46 
 
 
536 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.06 
 
 
493 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  32.46 
 
 
490 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.06 
 
 
493 aa  290  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  32.06 
 
 
493 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  31.85 
 
 
493 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  31.85 
 
 
493 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  31.85 
 
 
490 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.26 
 
 
509 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.17 
 
 
486 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.82 
 
 
485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.57 
 
 
484 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  31.44 
 
 
542 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.94 
 
 
473 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.17 
 
 
485 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.45 
 
 
484 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.11 
 
 
484 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.11 
 
 
484 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.42 
 
 
495 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.45 
 
 
484 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.9 
 
 
484 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.88 
 
 
485 aa  250  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.2 
 
 
500 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.78 
 
 
483 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.57 
 
 
473 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.13 
 
 
474 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  30.52 
 
 
485 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  31.6 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.59 
 
 
483 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.81 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.13 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  29.11 
 
 
473 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.6 
 
 
473 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  28.6 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.85 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  29.98 
 
 
524 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  28.93 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  37.15 
 
 
469 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  28.45 
 
 
473 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  28.45 
 
 
473 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.72 
 
 
473 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.27 
 
 
473 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.43 
 
 
472 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.67 
 
 
478 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.19 
 
 
476 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.35 
 
 
476 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.51 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.34 
 
 
472 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.21 
 
 
440 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.26 
 
 
466 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.17 
 
 
466 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  29.46 
 
 
471 aa  143  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.95 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  29.76 
 
 
468 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  23.73 
 
 
465 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.78 
 
 
464 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.78 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.03 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.58 
 
 
445 aa  127  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3477  ornithine decarboxylase  25.04 
 
 
761 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.48 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  24.76 
 
 
463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.88 
 
 
465 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0715  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1216  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.38 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2298  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2988  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1058  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1064  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1611  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.7 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175445  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2801  lysine decarboxylase, constitutive  24.62 
 
 
714 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2822  lysine decarboxylase, constitutive  24.62 
 
 
714 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2718  lysine decarboxylase, constitutive  24.62 
 
 
714 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2760  lysine decarboxylase, constitutive  24.62 
 
 
714 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>