239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11021 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  100 
 
 		 465 aa  951    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  57.08 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  52.8 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  51.29 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  52.79 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  52.58 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.14 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.02 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  44.23 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.66 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.4 
 
 		 491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.18 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  33.11 
 
 		 489 aa  216  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.85 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.23 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.69 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.23 
 
 		 488 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  27.19 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  26.97 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  27.19 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  28.29 
 
 		 488 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.37 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.42 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.99 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.43 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.9 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.79 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  25.89 
 
 		 536 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  26.12 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.99 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  27.05 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  26.97 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.9 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.09 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.58 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.8 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.21 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.94 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  31.58 
 
 		 542 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.85 
 
 		 473 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.75 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.17 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.59 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  26.59 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  26.59 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  26.15 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  26.59 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.88 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.64 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.64 
 
 		 473 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  27.11 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.74 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.06 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  25.73 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.5 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.15 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  28.04 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.41 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.35 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.93 
 
 		 484 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.31 
 
 		 445 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.31 
 
 		 445 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.98 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.79 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.79 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.85 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.02 
 
 		 501 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.1 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.42 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.73 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.73 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.28 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.95 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.54 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.51 
 
 		 484 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.36 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.67 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  28.54 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.29 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.34 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  23.76 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.56 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.69 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.88 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  22.82 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  25.37 
 
 		 749 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.19 
 
 		 751 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  25.07 
 
 		 757 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  24.85 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2491  lysine decarboxylase  22.15 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  22.71 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3498  lysine decarboxylase  23.58 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2393  Lysine decarboxylase  23.3 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.736843  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2020  lysine decarboxylase  23.34 
 
 		 777 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.605875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>