More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0707 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  100 
 
 		 489 aa  986    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  50.31 
 
 		 491 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  50.1 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  51.76 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  49.06 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  45.91 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  47.41 
 
 		 488 aa  438  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  42.99 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  41.41 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  43.16 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.78 
 
 		 495 aa  362  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.19 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  38.75 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.19 
 
 		 491 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.82 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.44 
 
 		 508 aa  335  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.21 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.85 
 
 		 509 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  35.43 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.75 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.73 
 
 		 484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  35.08 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.57 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.02 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  31.82 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  31.68 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  31.82 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  31.68 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  31.68 
 
 		 490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  31.68 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.11 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  31.9 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  31.7 
 
 		 536 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.4 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.92 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.11 
 
 		 495 aa  297  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.73 
 
 		 486 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  31.16 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.6 
 
 		 484 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.6 
 
 		 484 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.97 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.74 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.4 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.99 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.61 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.04 
 
 		 484 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.73 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.06 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.36 
 
 		 494 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.28 
 
 		 500 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  39.61 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.27 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.48 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.97 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.91 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  36.61 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  29.21 
 
 		 483 aa  233  6e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  30.9 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  30.9 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  37.99 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  31.24 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.12 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.15 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  30.47 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.69 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  37.06 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  30.69 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  30.9 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.16 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.73 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.54 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.92 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  31.9 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.25 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  33.11 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.89 
 
 		 465 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.85 
 
 		 498 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  33.78 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.42 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.01 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.92 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.46 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.67 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.62 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.58 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.96 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.96 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.23 
 
 		 464 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.59 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  27.41 
 
 		 767 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2967  ornithine decarboxylase  23.55 
 
 		 757 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.482503  normal  0.818361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  30.46 
 
 		 751 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  31.17 
 
 		 751 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  31.8 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.17 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2393  Lysine decarboxylase  29.55 
 
 		 762 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.736843  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  30.67 
 
 		 751 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29580  Ornithine/lysine/arginine decarboxylase  31.4 
 
 		 746 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  28.13 
 
 		 626 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.187258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>