More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0220 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  99.59 
 
 
484 aa  951    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  99.59 
 
 
484 aa  951    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  70.69 
 
 
484 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  100 
 
 
484 aa  955    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  39.88 
 
 
488 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  36.55 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.57 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.36 
 
 
491 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.01 
 
 
491 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.27 
 
 
484 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.81 
 
 
488 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.86 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.35 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.22 
 
 
473 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.54 
 
 
490 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.12 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.18 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  34.36 
 
 
490 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  33.68 
 
 
493 aa  302  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  33.47 
 
 
490 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  34.36 
 
 
536 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  33.68 
 
 
493 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  33.68 
 
 
490 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  33.68 
 
 
493 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.7 
 
 
482 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.15 
 
 
509 aa  299  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  33.47 
 
 
493 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.39 
 
 
490 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  33.47 
 
 
493 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  33.4 
 
 
486 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.09 
 
 
490 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.54 
 
 
487 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  38.4 
 
 
489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  32.04 
 
 
542 aa  283  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.24 
 
 
491 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.04 
 
 
474 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.22 
 
 
508 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.25 
 
 
509 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  31.39 
 
 
485 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.58 
 
 
485 aa  270  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  41.26 
 
 
495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.45 
 
 
485 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.29 
 
 
500 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  29.61 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.24 
 
 
486 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  29.31 
 
 
484 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.28 
 
 
483 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.4 
 
 
485 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.23 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  39.53 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.46 
 
 
473 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  33.4 
 
 
473 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.25 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.88 
 
 
494 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  32.33 
 
 
473 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.42 
 
 
473 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.13 
 
 
473 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  32.13 
 
 
473 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  31.91 
 
 
473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  31.91 
 
 
473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  32.26 
 
 
473 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.08 
 
 
472 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.32 
 
 
483 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  31.19 
 
 
524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.76 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.51 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  28.14 
 
 
483 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.54 
 
 
472 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.42 
 
 
477 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.77 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.34 
 
 
476 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.54 
 
 
479 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.26 
 
 
498 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3767  lysine decarboxylase  27.4 
 
 
713 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00012661  normal  0.0717066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3773  lysine decarboxylase  28.28 
 
 
714 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.231295  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  26.65 
 
 
445 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00184  lysine decarboxylase 2, constitutive  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3417  Lysine decarboxylase  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00183  hypothetical protein  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0179  lysine decarboxylase, constitutive  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0188  lysine decarboxylase, constitutive  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3474  lysine decarboxylase  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0196  lysine decarboxylase, constitutive  26.81 
 
 
713 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0197  lysine decarboxylase, constitutive  26.81 
 
 
713 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4372  lysine decarboxylase, constitutive  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.152714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4686  lysine decarboxylase homolog, constitutive  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04002  lysine decarboxylase 1  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.82832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3860  Lysine decarboxylase  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4600  lysine decarboxylase, constitutive  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.416329  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03964  hypothetical protein  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3896  lysine decarboxylase  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5647  lysine decarboxylase, constitutive  26.27 
 
 
715 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1007  L-lysine decarboxylase  25.86 
 
 
708 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0190  lysine decarboxylase, constitutive  26.59 
 
 
713 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.91 
 
 
466 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2718  lysine decarboxylase, constitutive  26.86 
 
 
714 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2801  lysine decarboxylase, constitutive  26.86 
 
 
714 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2760  lysine decarboxylase, constitutive  26.86 
 
 
714 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2822  lysine decarboxylase, constitutive  26.86 
 
 
714 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0261  lysine decarboxylase, constitutive  26.5 
 
 
713 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.658449  normal  0.265457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>