292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0031 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 		 483 aa  985    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.3 
 
 		 491 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.09 
 
 		 491 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.87 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.08 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.93 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.13 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.34 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.13 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.19 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.37 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  37.53 
 
 		 488 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  36.19 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.51 
 
 		 488 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.52 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  34.96 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.52 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.6 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.76 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.36 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  35.99 
 
 		 490 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.31 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  35.99 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  35.78 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  35.99 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  35.78 
 
 		 490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  35.78 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.78 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.42 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.12 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  34.99 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  35.34 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  34.91 
 
 		 490 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  34.91 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  34.73 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.44 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.67 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  35.65 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 		 485 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.2 
 
 		 484 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.84 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.91 
 
 		 485 aa  243  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  33.77 
 
 		 484 aa  243  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.56 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.17 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.78 
 
 		 477 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  33.4 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.18 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.77 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  32.79 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.48 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  32.99 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  33.2 
 
 		 473 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.99 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  32.99 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  33.98 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.82 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  32.79 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.89 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.03 
 
 		 486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.5 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  30.75 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.02 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.32 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.32 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.11 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.08 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.38 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.85 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  30.43 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.86 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.04 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.13 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.86 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.86 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.54 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.73 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.81 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.8 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  29.84 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.3 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.21 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.77 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.26 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1066  ornithine decarboxylase  27.09 
 
 		 730 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.06 
 
 		 465 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  29.63 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  27.85 
 
 		 468 aa  133  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1205  ornithine decarboxylase  25.36 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0159  ornithine decarboxylase  26.6 
 
 		 720 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0811  ornithine decarboxylase  26.42 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0811  ornithine decarboxylase  26.42 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.96 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0785  ornithine decarboxylase  25.64 
 
 		 735 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3363  ornithine decarboxylase  25.52 
 
 		 711 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.661844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0715  ornithine decarboxylase  25.17 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139092  normal  0.847041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0718  ornithine decarboxylase  25.3 
 
 		 735 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000376053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3289  ornithine decarboxylase  25.52 
 
 		 711 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00321092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3458  ornithine decarboxylase  25.52 
 
 		 711 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>