More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3055 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 		 485 aa  1003    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  73.03 
 
 		 483 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  68.32 
 
 		 484 aa  684    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  67.91 
 
 		 484 aa  681    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  67.71 
 
 		 485 aa  687    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  50.83 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  48.96 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  48.34 
 
 		 488 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  50.31 
 
 		 486 aa  465  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  46.07 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  45.33 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  43.66 
 
 		 499 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  42.71 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  42.71 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  45.27 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  43.6 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  42.09 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  42.51 
 
 		 493 aa  425  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  42.56 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  44.33 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  42.15 
 
 		 509 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  42.15 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  42.09 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  41.53 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  41.74 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.37 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.72 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  37.83 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.53 
 
 		 488 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.3 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.49 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.8 
 
 		 487 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.42 
 
 		 491 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.22 
 
 		 491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.86 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  33.58 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.03 
 
 		 500 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.85 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.38 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  36.09 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.28 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  31.61 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.88 
 
 		 494 aa  272  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 		 483 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  36.04 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.65 
 
 		 486 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.17 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.61 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.61 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.43 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  32.43 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  32.43 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  32.43 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.4 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  31.96 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.84 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.69 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  31.25 
 
 		 524 aa  230  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  31.48 
 
 		 473 aa  229  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.84 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.53 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.42 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.65 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.29 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  30.38 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.67 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.11 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.32 
 
 		 479 aa  210  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.55 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  31.58 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.82 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.32 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.75 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  28.24 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.21 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.81 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.43 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.43 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  25.86 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  27.74 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.51 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.78 
 
 		 751 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.7 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  28.88 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.8 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.65 
 
 		 751 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.98 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  23.62 
 
 		 626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.64 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.6 
 
 		 464 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.62 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.82 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  24.7 
 
 		 749 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29580  Ornithine/lysine/arginine decarboxylase  24.51 
 
 		 746 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0197  lysine decarboxylase, constitutive  23.54 
 
 		 713 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0272  lysine decarboxylase, constitutive  22.6 
 
 		 713 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.549018  normal  0.511484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0256  lysine decarboxylase, constitutive  22.6 
 
 		 713 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0196  lysine decarboxylase, constitutive  23.36 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>