More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1276 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  100 
 
 
542 aa  1107    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  52.29 
 
 
491 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  52.1 
 
 
491 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  52.1 
 
 
488 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  52.94 
 
 
488 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  52.32 
 
 
490 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  48.72 
 
 
486 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  42.99 
 
 
489 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.15 
 
 
491 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.19 
 
 
495 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.64 
 
 
493 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  36.97 
 
 
499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.13 
 
 
487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.63 
 
 
482 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.56 
 
 
490 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.48 
 
 
508 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.31 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.06 
 
 
490 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.58 
 
 
484 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.97 
 
 
490 aa  329  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  32.9 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.53 
 
 
493 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  32.84 
 
 
536 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  32.53 
 
 
493 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  32.53 
 
 
493 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.09 
 
 
509 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  32.65 
 
 
490 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  32.65 
 
 
490 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  34.39 
 
 
486 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  32.35 
 
 
493 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  32.35 
 
 
493 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.59 
 
 
488 aa  322  8e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.89 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.7 
 
 
484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.32 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.46 
 
 
473 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.33 
 
 
474 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  34.46 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.58 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.93 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.4 
 
 
483 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.96 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.23 
 
 
484 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.23 
 
 
484 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.04 
 
 
484 aa  270  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.1 
 
 
494 aa  263  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.94 
 
 
484 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  33.65 
 
 
469 aa  258  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.36 
 
 
486 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.28 
 
 
500 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.87 
 
 
478 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.78 
 
 
473 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.18 
 
 
473 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.09 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.98 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  29.36 
 
 
473 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.52 
 
 
473 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.43 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  38.64 
 
 
473 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  38.64 
 
 
473 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  38.64 
 
 
473 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  38.64 
 
 
473 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.78 
 
 
477 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  41.69 
 
 
495 aa  233  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  38.64 
 
 
473 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.22 
 
 
498 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  29.46 
 
 
524 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.67 
 
 
476 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.59 
 
 
476 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.77 
 
 
472 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  29.23 
 
 
468 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.91 
 
 
465 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.54 
 
 
479 aa  200  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  36.45 
 
 
483 aa  192  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.02 
 
 
501 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.44 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.02 
 
 
466 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  27.5 
 
 
471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  25.76 
 
 
751 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  26.02 
 
 
751 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  25.93 
 
 
749 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.06 
 
 
465 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  25.3 
 
 
757 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2068  lysine decarboxylase  25.85 
 
 
747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.014755  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.09 
 
 
466 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  24.48 
 
 
767 aa  146  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29580  Ornithine/lysine/arginine decarboxylase  25.89 
 
 
746 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  26.4 
 
 
749 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  26.27 
 
 
626 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.58 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.44 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.44 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.06 
 
 
465 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2393  Lysine decarboxylase  24.33 
 
 
762 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.736843  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2106  ornithine decarboxylase  24.41 
 
 
747 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.543581  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  34.72 
 
 
463 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0928  ornithine decarboxylase  25.7 
 
 
785 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335055  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  30.98 
 
 
751 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2341  Ornithine decarboxylase  24.23 
 
 
785 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.788512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12551  amino acid decarboxylase  24.56 
 
 
947 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0500695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>