65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0236 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  93.04 
 
 
158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  91.77 
 
 
158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  90.51 
 
 
158 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  48.1 
 
 
156 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  54.3 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  51.72 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  47.47 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  46.84 
 
 
156 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  46.84 
 
 
156 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  47.53 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  45.91 
 
 
159 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  45.91 
 
 
159 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  46.3 
 
 
162 aa  147  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  44.44 
 
 
162 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  43.83 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  43.83 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  40.82 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  39.74 
 
 
163 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  36.48 
 
 
170 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  33.57 
 
 
142 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  32.48 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.29 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  38.24 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  38.24 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  34.87 
 
 
170 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  37.5 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  36.14 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  31.61 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  32.16 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  31.61 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  35.34 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  31.61 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  32.61 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  31.01 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  27.33 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  29.63 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  27.95 
 
 
383 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  28.1 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  28.1 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  28.1 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  28.1 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  28.1 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  26.71 
 
 
356 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  26.21 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  26.21 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.21 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  26.21 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  26.21 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  26.21 
 
 
347 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  26.21 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  38.24 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.19 
 
 
325 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  28.19 
 
 
325 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  28.19 
 
 
325 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  28.19 
 
 
335 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  28.19 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  25.14 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  30.07 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  28.19 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  28.19 
 
 
335 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>