54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00483 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  99.38 
 
 
335 aa  666    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  100 
 
 
325 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
325 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  98.46 
 
 
335 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  98.77 
 
 
335 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  99.38 
 
 
335 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  99.38 
 
 
335 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  70.5 
 
 
335 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  70.5 
 
 
335 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  70.5 
 
 
335 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  70.81 
 
 
335 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  70.5 
 
 
335 aa  477  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  64.78 
 
 
335 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  44.27 
 
 
335 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  43.6 
 
 
335 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  43.6 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  43.6 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  43.6 
 
 
335 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  34.51 
 
 
349 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  28.72 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  28.72 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  27.34 
 
 
351 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  28.14 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  26.53 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  26.53 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  25.87 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  26.02 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  26.02 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  26.4 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.87 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  25.87 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  27.32 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  25.87 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  25.87 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  26.02 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  26.37 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  24 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  26.87 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  25.12 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  25.12 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  23.12 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.44 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  22.61 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  23.12 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  23.12 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.12 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  23.12 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  25 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  28.95 
 
 
158 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  26.85 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  26.85 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  27.52 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  27.52 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>