54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4141 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  100 
 
 		 166 aa  343  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  56.33 
 
 		 170 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  43.95 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  38.04 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  38.89 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  38.89 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  38.19 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  38.19 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  36.64 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  42.76 
 
 		 142 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  38.82 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  35.88 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  33.97 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  35.88 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  35.11 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  33.97 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  33.12 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  36.91 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  36.91 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  38 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  32.48 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  36.23 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  37.32 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  33.83 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  36.62 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  36.62 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  36.62 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.59 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  36.73 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  34.9 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  35.29 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  35.07 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  33.55 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  34.33 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  34.33 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  34.33 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  32.45 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.45 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  33.14 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  31.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  31.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  31.84 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  27.27 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  31.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  31.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  31.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  31.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  30.26 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  25.32 
 
 		 360 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  26.97 
 
 		 335 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  23.72 
 
 		 383 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>