44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2629 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  82.72 
 
 
162 aa  286  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  75.31 
 
 
162 aa  251  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  74.69 
 
 
162 aa  250  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  74.69 
 
 
162 aa  250  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  46.91 
 
 
159 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  46.91 
 
 
159 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  48.15 
 
 
158 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  48.15 
 
 
158 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  48.15 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  51.77 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  47.53 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  48.23 
 
 
149 aa  147  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  44.1 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  43.48 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  44.1 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  44.1 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  35.19 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  34.57 
 
 
168 aa  87  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  36.73 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  33.33 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  30.91 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  30.19 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  33.14 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  33.14 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  32.54 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  32.54 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  32.39 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  32.39 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  32.39 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  32.4 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  32.91 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  29.05 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  29.05 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  29.05 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  30.14 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  28 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  27.72 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  26.99 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  25.17 
 
 
334 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  24.2 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  28.46 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  27.45 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>