41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02260 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  53.46 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  56.79 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  56.79 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  56.79 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  52.07 
 
 		 167 aa  176  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  59.59 
 
 		 163 aa  177  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  53.06 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  52.38 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  51.7 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  51.7 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  44.05 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  44.64 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  44.05 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  44.05 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  57.47 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  36 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  35.1 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  34.86 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  35.29 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  34.59 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  36.57 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  35.46 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  32.61 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  32.61 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  32.61 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  33.57 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  33.79 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  31.94 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  33.57 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  33.79 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  34.07 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  28 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  34.06 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.6 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  30.83 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  29.17 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>