42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3476 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  81.21 
 
 
149 aa  261  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  53.42 
 
 
158 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  53.02 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  54.3 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  53.02 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  51.01 
 
 
162 aa  159  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  47.68 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  47.68 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  48.23 
 
 
162 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  49.31 
 
 
162 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  48.61 
 
 
162 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  48.61 
 
 
162 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  47.55 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  47.55 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  46.85 
 
 
156 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  46.85 
 
 
156 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  39.13 
 
 
163 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  37.14 
 
 
170 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  36.91 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  31.94 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  35.29 
 
 
166 aa  80.1  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  37.04 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  37.04 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  35.56 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  34.81 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  34.81 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  31.85 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  34.81 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  34.81 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  32.08 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  30.22 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  32.84 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  34.07 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  31.97 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  31.97 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  31.97 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.06 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  34.06 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  30.82 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  26.76 
 
 
334 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  22.84 
 
 
360 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>