42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3174 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  98.81 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  98.21 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  54.82 
 
 		 170 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  53.61 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  54.22 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  53.01 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  45.18 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  44.83 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  44.05 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  42.24 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  42.24 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  47.62 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  43.4 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  40.99 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  32.16 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  32.69 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  29.88 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  34.33 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  45.45 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  31.61 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  36.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  33.14 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  36.55 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  32.54 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  33.14 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  35.86 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  35.86 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  30.87 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  30.82 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  30.82 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.25 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  31.97 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  34.03 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  30.25 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  33.59 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  32.85 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  29.85 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  25.71 
 
 		 334 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>