77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3175 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  98.08 
 
 
156 aa  311  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  97.44 
 
 
156 aa  310  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  48.1 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  46.84 
 
 
158 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  46.84 
 
 
158 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  46.84 
 
 
158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  46.85 
 
 
149 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  50 
 
 
149 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  42.14 
 
 
159 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  42.14 
 
 
159 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  46.58 
 
 
162 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  44.1 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  46.58 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  46.58 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  43.48 
 
 
162 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  41.33 
 
 
163 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  37.59 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  39.13 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  35.97 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  37.14 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  36.62 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  35.26 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  34.09 
 
 
334 aa  77.4  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  38.06 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  35.86 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  33.92 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  35.86 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  35.86 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  32.73 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  36.57 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  36.57 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  35.17 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  35.82 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  33.8 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  33.8 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  33.8 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  36.09 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  33.79 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.79 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  27.74 
 
 
356 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  27.74 
 
 
356 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  27.74 
 
 
347 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  26.49 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  24.83 
 
 
335 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  24.83 
 
 
335 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  24.83 
 
 
335 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  24.83 
 
 
335 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  26.99 
 
 
383 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  25.32 
 
 
359 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  25.32 
 
 
359 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  24.83 
 
 
335 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  27.7 
 
 
335 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  27.03 
 
 
335 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  27.03 
 
 
335 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  27.03 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  26.97 
 
 
359 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  26.97 
 
 
359 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  26.97 
 
 
359 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.52 
 
 
325 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  27.52 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  27.52 
 
 
325 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  27.52 
 
 
325 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  26.35 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  27.52 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  27.52 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  26.35 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  27.52 
 
 
335 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  27.52 
 
 
335 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  26.97 
 
 
358 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  26.53 
 
 
358 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>