56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0235 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  100 
 
 		 158 aa  326  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  90.51 
 
 		 158 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  84.18 
 
 		 158 aa  280  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  82.91 
 
 		 158 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  49.37 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  48.73 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  48.1 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  48.1 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  53.42 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  51.03 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  47.17 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  47.17 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  48.15 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  46.91 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  46.3 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  45.68 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  45.68 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  39.63 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  40.14 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  36.48 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  33.57 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  33.12 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  34.87 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  37.31 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  37.31 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  36.57 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.1 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  35.1 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  35.56 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  36.75 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  32.75 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  32.16 
 
 		 168 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  35.8 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  32.16 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  32.16 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  35.34 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  30.77 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  29.11 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  26.71 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  27.33 
 
 		 383 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  40.28 
 
 		 88 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  29.61 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  28.95 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  28.95 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  28.95 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  28.95 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  28.95 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.95 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  28.95 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>