61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0026 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  100 
 
 		 335 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  99.4 
 
 		 335 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  98.81 
 
 		 335 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  99.4 
 
 		 335 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  99.4 
 
 		 335 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  48.19 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  47.89 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  47.89 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  47.59 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  47.29 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  45.62 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  44.83 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  43.37 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  44.2 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  43.6 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  43.6 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  43.6 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  43.37 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  44.51 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  35.54 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  31.39 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  31.11 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  31.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  31.45 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.45 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  31.45 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  31.45 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  30.38 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  27.15 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  30.05 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  30.05 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  30.53 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  29.9 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  30.53 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  29.47 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  30 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  26.61 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  25.76 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  29.65 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  32.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  31.73 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  31.25 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.25 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  31.25 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  28.44 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  24.64 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  23.12 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.12 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  24.84 
 
 		 156 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  24.83 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  24.83 
 
 		 156 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  24 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  28.67 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  26.74 
 
 		 158 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  28.1 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  26.74 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  24.4 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  27.45 
 
 		 158 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>