58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2451 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  100 
 
 
383 aa  786    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.06 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  28.06 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  28.06 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  28.06 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  28.29 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  27.9 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  25.26 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  26.23 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  26.23 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  28.28 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  26.23 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  31.96 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.96 
 
 
356 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  31.96 
 
 
356 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  31.96 
 
 
356 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  31.96 
 
 
356 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  31.44 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  31.44 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  29.47 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  29.47 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  30.1 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  23.13 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  29.7 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  28.57 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  29.79 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  29.65 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  29.65 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  29.65 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  29.65 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  29.65 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  24.52 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  24.52 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  29.59 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  26.27 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  26.32 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  26.32 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  26.42 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  26.32 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  26.32 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  29.75 
 
 
335 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  27.33 
 
 
158 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  26.67 
 
 
334 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  25 
 
 
325 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  25 
 
 
325 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  25 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  25 
 
 
335 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  25 
 
 
335 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  24.04 
 
 
335 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  27.95 
 
 
158 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  25.62 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  26.99 
 
 
156 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  27.95 
 
 
158 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  26.99 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  27.95 
 
 
158 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  26.99 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  26.38 
 
 
156 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>