50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4093 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  100 
 
 		 356 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  83.47 
 
 		 357 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  83.47 
 
 		 357 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  41.99 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  38.95 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  28.53 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  28.53 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  28.53 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  27.99 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  27.57 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  29.02 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  28.05 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  28.05 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  27.02 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  29 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  25.57 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  24.86 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  24.86 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.86 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  24.86 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  24.86 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  24.86 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  24.22 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  24.59 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  25 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  24.91 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  25 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  25 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  25 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  24.46 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  23.26 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  24.21 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  24.21 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  23.92 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  24.13 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  22.77 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  23.15 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  23.15 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.15 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  23.15 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  23.15 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  23.15 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  23.15 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  24.32 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  24.78 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  24.46 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  24.46 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  24.78 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  24.49 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>