50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2280 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  38.18 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  38.18 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  38.18 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  37.88 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  37.58 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  35.37 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  35.37 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  35.06 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  35.06 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.51 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  34.51 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  34.51 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  33.72 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  33.72 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  36.23 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  35.54 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  35.54 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  35.54 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  35.54 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  30.79 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  28.85 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  29.88 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  29.59 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.59 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  29.59 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  29.59 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  28.05 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  28.57 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  28.47 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  25.23 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  27.27 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  27.27 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  27.7 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  28.95 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  28.95 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  27.52 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  27.8 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  29.89 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  27.8 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  27.8 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  27.01 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  27.35 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  29.59 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  27.35 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  27.35 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.35 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  27.35 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  26.53 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  24.43 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>