57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2178 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  89.89 
 
 		 356 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  100 
 
 		 356 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  91.28 
 
 		 347 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  90.17 
 
 		 356 aa  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  89.89 
 
 		 356 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  89.89 
 
 		 356 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  89.89 
 
 		 356 aa  661    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  89.89 
 
 		 356 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  30.58 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  30.31 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  30.19 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  30.19 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  30.19 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  27.95 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  27.67 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  28.61 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  28.38 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  28.38 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  28.05 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  27.83 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  26.32 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  26.32 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  26.12 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  24.04 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  26.95 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  28.06 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  30.1 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  28 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  28 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  28 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  25.74 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  28 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.4 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  26.4 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  26.4 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  26.4 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  26.4 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  26.4 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  26.4 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  25.89 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.45 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.16 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  23.16 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  21.76 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  24.03 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  22.25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  22.25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  22.25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  22.25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  22.79 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  27.54 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  27.74 
 
 		 156 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  27.74 
 
 		 156 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  26.81 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 158 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>