53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0593 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0600  mannose binding protein FimH  99.1 
 
 
335 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.11786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0657  mannose binding protein FimH  98.81 
 
 
335 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0592  mannose binding protein FimH  98.51 
 
 
335 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.0333471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0593  mannose binding protein FimH  100 
 
 
335 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0596  mannose binding protein FimH  99.1 
 
 
335 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3089  fimbrial asembly protein  70.36 
 
 
335 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596459  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0608  mannose binding protein FimH-like protein  70.36 
 
 
335 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.565914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0578  mannose binding protein FimH-like protein  70.96 
 
 
335 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0991  minor fimbrial subunit  72.15 
 
 
335 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0634  mannose binding protein FimH homolog  70.66 
 
 
335 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.732186  normal  0.432125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00483  predicted fimbrial-like adhesin protein  70.5 
 
 
325 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0576  mannose binding protein FimH  70.06 
 
 
335 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3080  involved in fimbrial asembly  70.5 
 
 
325 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00488  hypothetical protein  70.5 
 
 
325 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  47.89 
 
 
335 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  47.89 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  47.89 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  47.59 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  47.59 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2280  hypothetical protein  38.18 
 
 
349 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3850  protein LpfD  27.14 
 
 
354 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3959  long polar fimbrial protein  29.03 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3915  long polar fimbrial protein  29.03 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4918  protein LpfD  28.57 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.57 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  28.57 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  28.57 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  28.57 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  26.27 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  28 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1056  putative fimbrial protein  25.88 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5159  fimbrial family protein  29.27 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.592502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  26.9 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0193  putative fimbrial protein precurosr  26.4 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  26.56 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  26.56 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  26.56 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03012  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.01 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02963  hypothetical protein  28.01 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0560  putative fimbrial protein  28.01 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3337  putative fimbrial protein  28.01 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.269442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0553  putative fimbrial protein  28.01 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.164152  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3627  putative fimbrial protein  26.7 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4240  fimbrial family protein  23.74 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4199  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.74 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  26.32 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5160  putative fimbrial protein  28.16 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4093  long polar fimbrial operon protein LpfD  23.24 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.234808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  27.7 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  27.7 
 
 
156 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  27.03 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  27.03 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>