42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4142 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  100 
 
 		 170 aa  347  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  56.33 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  41.18 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  37.23 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  33.99 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  32.7 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  32.7 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  30.49 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  32.7 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  29.88 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  29.88 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  29.88 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  35.26 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  32.08 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  35.26 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  34.62 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  37.93 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  34.62 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  34.34 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  34.34 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  33.11 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  33.73 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  31.01 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  33.11 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.46 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  35.46 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  33.11 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  29.11 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  31.82 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  31.06 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  32.91 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  32.08 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  32.06 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  33.54 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.39 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  28.39 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  30.34 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  26.52 
 
 		 334 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  26.26 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>