121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0882 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0882  thermostable carboxypeptidase 1  100 
 
 		 351 aa  736    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  63.85 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  63.51 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  63.51 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  62.76 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  62.76 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  62.16 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  62.41 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  61.72 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  62.41 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  60.47 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  61.56 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  60.81 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  55.82 
 
 		 499 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  52.61 
 
 		 524 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  51.22 
 
 		 493 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  50.17 
 
 		 494 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  50.89 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  49.83 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  48.78 
 
 		 494 aa  298  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  46.34 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  48.46 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  48.46 
 
 		 499 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  48.46 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  44.93 
 
 		 498 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  45.36 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  43.34 
 
 		 501 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  44.64 
 
 		 496 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  42.36 
 
 		 499 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  38.56 
 
 		 493 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  40.28 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  42.47 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  42.52 
 
 		 512 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  41.67 
 
 		 499 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  40.97 
 
 		 495 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  40.28 
 
 		 502 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  40.68 
 
 		 497 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  39.79 
 
 		 499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  38.41 
 
 		 498 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  38.06 
 
 		 497 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  38.06 
 
 		 497 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  37.24 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  35.62 
 
 		 501 aa  202  9e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  34.32 
 
 		 507 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  36.62 
 
 		 493 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  35.23 
 
 		 502 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  31.6 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  31.09 
 
 		 524 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  32.04 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  33.9 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  33.45 
 
 		 497 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  29.83 
 
 		 525 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  34.72 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  33.33 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  29.12 
 
 		 491 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  33.67 
 
 		 509 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  31.36 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  32.71 
 
 		 488 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  31.7 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  31.08 
 
 		 505 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  30.34 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  30.5 
 
 		 509 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  32.83 
 
 		 493 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  32.08 
 
 		 493 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  32.83 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  30.07 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  28.62 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  30.38 
 
 		 507 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  28.24 
 
 		 505 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  27.91 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  27.91 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  27.91 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  28.27 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  28 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  28.2 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  33.08 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  28.92 
 
 		 507 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  27.91 
 
 		 505 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  28.24 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  28.73 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  26.91 
 
 		 505 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  30.9 
 
 		 491 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  28.67 
 
 		 493 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  29.82 
 
 		 539 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  27.15 
 
 		 499 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  26.58 
 
 		 505 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  28.57 
 
 		 502 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  30.9 
 
 		 467 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  29.74 
 
 		 512 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  28.52 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  29.09 
 
 		 501 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  28.8 
 
 		 582 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  30.2 
 
 		 507 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  28.32 
 
 		 491 aa  122  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  29.39 
 
 		 498 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  30.04 
 
 		 497 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  31.21 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  29.19 
 
 		 505 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  29.59 
 
 		 513 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  27.27 
 
 		 490 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>