123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1549 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  100 
 
 		 513 aa  1046    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  91.77 
 
 		 498 aa  934    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  63.25 
 
 		 501 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  66.06 
 
 		 503 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  57.03 
 
 		 512 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  50.7 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  49.3 
 
 		 497 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  46.39 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  47.22 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  48.42 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  48.6 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  46.23 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  41.9 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  41.7 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  42.12 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  40.36 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  40.98 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  40.46 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  37.68 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  42.78 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  42.77 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  37 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  41.03 
 
 		 508 aa  364  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  35.64 
 
 		 506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  40.97 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  36.33 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  37.53 
 
 		 505 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  39.17 
 
 		 500 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  37.53 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 		 505 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  37.32 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  36.92 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 		 505 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  37.12 
 
 		 505 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  40.16 
 
 		 509 aa  348  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  36.71 
 
 		 505 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  37.89 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  36.13 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  38.16 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  35.8 
 
 		 493 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  38.76 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  37.3 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  37.29 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  40.38 
 
 		 488 aa  319  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  39.31 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  39.96 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  39.56 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  35.74 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  37.98 
 
 		 493 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  38.31 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  34.76 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  38.06 
 
 		 512 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  37.78 
 
 		 493 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  38.42 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  35.34 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  36.04 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  38.8 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  38.65 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  38.53 
 
 		 493 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  37.24 
 
 		 509 aa  293  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  35.67 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  35.87 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  38.38 
 
 		 497 aa  290  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  39.27 
 
 		 499 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  31.4 
 
 		 501 aa  286  5e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  38.52 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  32.79 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  37.81 
 
 		 495 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  35.61 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  35.32 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  40.04 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  33.95 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  34.78 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  33.93 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  31.78 
 
 		 501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  38.56 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  35.94 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  35.56 
 
 		 493 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  32.86 
 
 		 494 aa  266  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  33.2 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  33.4 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  32.6 
 
 		 498 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0383  Carboxypeptidase Taq  30.24 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  33.4 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  33.2 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  33.6 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0317  Carboxypeptidase Taq  32.73 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00666453  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  33.6 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  33.2 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  34.14 
 
 		 501 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  30.65 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0676  thermostable carboxypeptidase 1  35.35 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  32.8 
 
 		 501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  33.4 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  34.74 
 
 		 501 aa  253  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  33.33 
 
 		 501 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  34.21 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  32.55 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>