123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1824 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  67.07 
 
 
494 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  100 
 
 
499 aa  1038    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  77.26 
 
 
498 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  99.2 
 
 
499 aa  1029    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  99.8 
 
 
499 aa  1035    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  58.62 
 
 
496 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  56.63 
 
 
504 aa  585  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  55.94 
 
 
494 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  55.62 
 
 
524 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  56.34 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  55.71 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  55.33 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  54.53 
 
 
494 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  53.41 
 
 
501 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  53.01 
 
 
501 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  52.81 
 
 
501 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  52.21 
 
 
497 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  50.51 
 
 
496 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  51.2 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  51.2 
 
 
501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  51.2 
 
 
501 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  50.91 
 
 
494 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  51.1 
 
 
501 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  50.91 
 
 
501 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  51.5 
 
 
493 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  50 
 
 
496 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  49.3 
 
 
501 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  49.4 
 
 
502 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  47.39 
 
 
499 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  44.27 
 
 
493 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  44.24 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  47.59 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  46.08 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  45.98 
 
 
501 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  47.4 
 
 
512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  47.09 
 
 
499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  47.28 
 
 
497 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  47.48 
 
 
497 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  46.49 
 
 
497 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  46.48 
 
 
499 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  44.49 
 
 
504 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  38.92 
 
 
501 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  37.97 
 
 
508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  38.63 
 
 
507 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  38.31 
 
 
528 aa  335  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  38.38 
 
 
497 aa  327  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  36.82 
 
 
509 aa  325  9e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  37.84 
 
 
493 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  35.79 
 
 
499 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  34.82 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  33.4 
 
 
502 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  34.54 
 
 
505 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  35.1 
 
 
524 aa  319  9e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  34.14 
 
 
505 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  34.41 
 
 
505 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  36.83 
 
 
505 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  36.45 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  34.14 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  36.48 
 
 
500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  33.87 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  37.84 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  37.7 
 
 
509 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  35.29 
 
 
507 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  36.8 
 
 
502 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  37.24 
 
 
505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  35.38 
 
 
500 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  35.16 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  35.87 
 
 
514 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  36.29 
 
 
489 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34.61 
 
 
509 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  35.07 
 
 
490 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  35.85 
 
 
582 aa  293  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  35.86 
 
 
493 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  35.66 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  32.66 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  33.26 
 
 
506 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  32.53 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  35.79 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0882  thermostable carboxypeptidase 1  48.46 
 
 
351 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  30.86 
 
 
501 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  34.13 
 
 
497 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  34.72 
 
 
539 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  35.45 
 
 
501 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  33.68 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  35.45 
 
 
490 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  34.09 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  33.27 
 
 
507 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  32.67 
 
 
496 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  32.92 
 
 
490 aa  271  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  35.37 
 
 
497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  32.79 
 
 
490 aa  266  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  31.91 
 
 
509 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  32.3 
 
 
497 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  31.82 
 
 
491 aa  264  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>