123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2902 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  92.96 
 
 		 497 aa  973    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  98 
 
 		 501 aa  1023    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  100 
 
 		 501 aa  1044    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  97.01 
 
 		 501 aa  1016    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  68.23 
 
 		 493 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  85.28 
 
 		 501 aa  897    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  63.06 
 
 		 499 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  84.48 
 
 		 501 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  68.16 
 
 		 496 aa  705    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  67.54 
 
 		 494 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  84.27 
 
 		 501 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  66.94 
 
 		 496 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  84.88 
 
 		 501 aa  892    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  54.6 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  54.58 
 
 		 524 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  54.18 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  55.28 
 
 		 493 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  53.99 
 
 		 490 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  54.08 
 
 		 494 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  53.25 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  52.81 
 
 		 499 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  52.81 
 
 		 499 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  51.41 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  52.81 
 
 		 499 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  50.91 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  50.91 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  46.15 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  46.6 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  47.87 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  47.37 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  45.14 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  44.78 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  45.23 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  41.9 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  41.78 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  44.51 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  43.93 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  43.72 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  45.75 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0882  thermostable carboxypeptidase 1  63.85 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  43.23 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  41.92 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  38.43 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  38.23 
 
 		 502 aa  326  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  37.32 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  34.42 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  34.84 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  33.54 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  34.9 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  32.92 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  36.9 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  32.93 
 
 		 505 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  33.13 
 
 		 505 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 505 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  32.93 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  33.13 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  32.72 
 
 		 505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  34.12 
 
 		 582 aa  306  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  34.37 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  33.95 
 
 		 507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  36.34 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  36.69 
 
 		 514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  36.07 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  34.47 
 
 		 505 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  34 
 
 		 490 aa  294  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  32.8 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  34 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  33.26 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  32.61 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  34.89 
 
 		 507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  32.28 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0880  carboxypeptidase  68.23 
 
 		 196 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  35.57 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  33.53 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  33.81 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  32.52 
 
 		 491 aa  279  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  34.65 
 
 		 539 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  33.26 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  31.43 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  35.61 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  35.61 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  35.61 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  36.73 
 
 		 490 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  32.86 
 
 		 497 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  34.94 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  32.04 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  32.39 
 
 		 482 aa  267  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  32.72 
 
 		 489 aa  266  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  34.31 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  30.67 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  30.65 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  34 
 
 		 503 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  34.14 
 
 		 513 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>