123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1020 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  67.34 
 
 
497 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  68.03 
 
 
501 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  68.16 
 
 
501 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  68.16 
 
 
501 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  63.14 
 
 
493 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  68.16 
 
 
501 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  65.11 
 
 
499 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  67.76 
 
 
501 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  100 
 
 
496 aa  1037    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  70.35 
 
 
494 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  67.35 
 
 
501 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  75.2 
 
 
496 aa  811    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  67.69 
 
 
501 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  52.85 
 
 
494 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  55.28 
 
 
524 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  52.87 
 
 
490 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  53.66 
 
 
493 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  53.66 
 
 
494 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  53.27 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  52.05 
 
 
490 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  51.09 
 
 
498 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  50 
 
 
499 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  50 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  50 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  50.89 
 
 
504 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  51.12 
 
 
496 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  47.98 
 
 
501 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  42.45 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  43.8 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  43.7 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  42.24 
 
 
493 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  43.29 
 
 
497 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  42.89 
 
 
497 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  45.56 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  43.46 
 
 
498 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  43.61 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  43.8 
 
 
497 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  42.25 
 
 
495 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  43.09 
 
 
501 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  41.53 
 
 
504 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  42.45 
 
 
499 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0882  thermostable carboxypeptidase 1  60.81 
 
 
351 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  37.04 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  38.14 
 
 
493 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  37.04 
 
 
508 aa  323  4e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  37.85 
 
 
528 aa  322  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  37.45 
 
 
502 aa  319  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  37.92 
 
 
500 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  37.07 
 
 
497 aa  317  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  36.55 
 
 
500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  36.79 
 
 
507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  33.33 
 
 
491 aa  312  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  36.96 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  35.06 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  34.84 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  35.71 
 
 
506 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  35.17 
 
 
505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  35.81 
 
 
514 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  34.69 
 
 
505 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  34.63 
 
 
505 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  35.87 
 
 
505 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  34.56 
 
 
505 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  34.27 
 
 
505 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  35.52 
 
 
507 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  35.85 
 
 
539 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  33.79 
 
 
525 aa  294  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  33.79 
 
 
524 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  34.83 
 
 
582 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  34.29 
 
 
490 aa  291  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  34.22 
 
 
507 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  32.79 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  36.23 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  33.07 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  33.13 
 
 
491 aa  283  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  35.57 
 
 
509 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  34.08 
 
 
491 aa  281  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  32.04 
 
 
490 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  34.23 
 
 
488 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  32.8 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0880  carboxypeptidase  63.02 
 
 
196 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  32.92 
 
 
490 aa  269  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  33.27 
 
 
482 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 
499 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  31.72 
 
 
496 aa  266  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  30.96 
 
 
501 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  32.26 
 
 
497 aa  263  4e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05571  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  32.64 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  32.02 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0494  thermostable carboxypeptidase 1  34.02 
 
 
501 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.178515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  32.02 
 
 
503 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05501  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  34.01 
 
 
509 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.30292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  34.99 
 
 
490 aa  260  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1826  thermostable carboxypeptidase 1  34.01 
 
 
509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  30.82 
 
 
493 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  33.27 
 
 
501 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>