123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3700 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  71.52 
 
 		 493 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  100 
 
 		 490 aa  991    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  71.52 
 
 		 493 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  70.29 
 
 		 493 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  67.14 
 
 		 490 aa  668    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  62.91 
 
 		 488 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  60.41 
 
 		 489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  42.94 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  42.48 
 
 		 514 aa  359  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  43.26 
 
 		 507 aa  358  9e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  42.44 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  39.67 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  40.33 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  39.33 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  41.4 
 
 		 503 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  39.92 
 
 		 497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  38.52 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  39.55 
 
 		 497 aa  335  9e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  39.39 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  39.96 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  36.6 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  39.67 
 
 		 509 aa  329  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  37.88 
 
 		 524 aa  326  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  34.83 
 
 		 502 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  39.92 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  34.47 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  38.35 
 
 		 501 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  35.07 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  34.84 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  39.96 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  35.21 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  39.43 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  34.82 
 
 		 506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  36.11 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  36.52 
 
 		 525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  36.06 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  40.25 
 
 		 502 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  35.66 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  34.2 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  35.46 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  35.46 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  35.46 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  35.46 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  34.67 
 
 		 505 aa  299  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  35.26 
 
 		 505 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  35.26 
 
 		 505 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  39.5 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  34.21 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  34.21 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  35.27 
 
 		 499 aa  296  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  35.54 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  35.07 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  34.62 
 
 		 490 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  35.07 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  37.71 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  37.58 
 
 		 509 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  32.66 
 
 		 494 aa  293  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  38.66 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  39.15 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  34.83 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  36.48 
 
 		 490 aa  291  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  35.42 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  33.06 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  37.37 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  34.08 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  36.61 
 
 		 491 aa  287  4e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  37.65 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  37.47 
 
 		 491 aa  280  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  31.84 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  32.86 
 
 		 498 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  36.03 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  38.38 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  38.32 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  37.24 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  32.6 
 
 		 494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  31.93 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  29.84 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  29.44 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  39.84 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  35.1 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  34.29 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  35.07 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  34.48 
 
 		 501 aa  270  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  34.62 
 
 		 514 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  35.42 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  37.85 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  34.91 
 
 		 516 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  37.85 
 
 		 497 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  31.03 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1826  thermostable carboxypeptidase 1  31.64 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  33.68 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  33.47 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05501  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  31.45 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.30292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  37.65 
 
 		 499 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  33.4 
 
 		 497 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  33.8 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  35.13 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  32.52 
 
 		 501 aa  262  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  33.77 
 
 		 494 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>