124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1098 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  100 
 
 
509 aa  1018    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  52.1 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  50.71 
 
 
514 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  48.42 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  48.11 
 
 
503 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  45.73 
 
 
501 aa  458  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  48.3 
 
 
498 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  47.98 
 
 
497 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  46.34 
 
 
507 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  44.09 
 
 
507 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  43.23 
 
 
512 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  44.79 
 
 
509 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  44.95 
 
 
508 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  44.4 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  39.11 
 
 
491 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  41.43 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  43.81 
 
 
509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  42.39 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  40.6 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  42.89 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  42.57 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  38.05 
 
 
506 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  42.03 
 
 
502 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  37.45 
 
 
502 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  39.92 
 
 
500 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  43.81 
 
 
497 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  42.83 
 
 
525 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  40.16 
 
 
500 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  43.92 
 
 
539 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  42.04 
 
 
528 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  42.02 
 
 
505 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  38.83 
 
 
505 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  39.03 
 
 
505 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  38.83 
 
 
505 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  39.03 
 
 
505 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  39.03 
 
 
505 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  39.03 
 
 
505 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  37.83 
 
 
505 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  38.83 
 
 
505 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  38.23 
 
 
505 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  38.23 
 
 
505 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  37.6 
 
 
507 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  42.53 
 
 
490 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  40.4 
 
 
490 aa  361  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  41.13 
 
 
490 aa  358  9e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  40.52 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  40.52 
 
 
493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  39.08 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  35.29 
 
 
493 aa  356  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  36.42 
 
 
490 aa  356  6.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  40.78 
 
 
509 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  41.54 
 
 
491 aa  355  1e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  38.79 
 
 
491 aa  351  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  39.72 
 
 
493 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0541  carboxypeptidase Taq  41.05 
 
 
501 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  40.85 
 
 
512 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  35.61 
 
 
501 aa  342  7e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  41.63 
 
 
498 aa  342  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  38.93 
 
 
514 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  40.73 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  38.35 
 
 
497 aa  332  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  40.45 
 
 
499 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  40 
 
 
488 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0320  Carboxypeptidase Taq  41.26 
 
 
497 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  0.145464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  39.8 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3931  carboxypeptidase Taq  43.2 
 
 
499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0276  carboxypeptidase Taq  40.61 
 
 
497 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.591351  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  37.89 
 
 
499 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  37.89 
 
 
499 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  40.37 
 
 
495 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  38.36 
 
 
489 aa  323  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  37.7 
 
 
499 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0676  carboxypeptidase Taq  41.38 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789368  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  38.26 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  37.12 
 
 
467 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  41.09 
 
 
504 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  36.29 
 
 
524 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  38.88 
 
 
502 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  37.25 
 
 
498 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0724  carboxypeptidase Taq  40.32 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  35.94 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  35.15 
 
 
490 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  35.48 
 
 
490 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  34.82 
 
 
582 aa  307  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  36.03 
 
 
493 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  39.41 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  33.66 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  34.07 
 
 
494 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  32.32 
 
 
493 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  32.19 
 
 
493 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  35.98 
 
 
497 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  36.18 
 
 
501 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  31.74 
 
 
501 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  35.25 
 
 
501 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  36.51 
 
 
516 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1685  thermostable carboxypeptidase 1  37.55 
 
 
501 aa  292  9e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.950638  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  35.77 
 
 
501 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  36.59 
 
 
493 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0383  Carboxypeptidase Taq  32.01 
 
 
503 aa  289  9e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0676  thermostable carboxypeptidase 1  37.78 
 
 
502 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.203621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>