123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2086 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2086  Carboxypeptidase Taq  100 
 
 
502 aa  1025    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1160  Carboxypeptidase Taq  76.84 
 
 
493 aa  794    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.263601  decreased coverage  0.00219569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1978  carboxypeptidase Taq  54.89 
 
 
528 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0595  Carboxypeptidase Taq  48.31 
 
 
507 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1392  Carboxypeptidase Taq  45.33 
 
 
514 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.04918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0617  Carboxypeptidase Taq  41.43 
 
 
507 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04150  Carboxypeptidase Taq  39.47 
 
 
506 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2889  Carboxypeptidase Taq  38.87 
 
 
502 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  42.03 
 
 
509 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1394  Carboxypeptidase Taq  41.22 
 
 
503 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2911  carboxypeptidase Taq  40.24 
 
 
497 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000970624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1549  carboxypeptidase Taq  42.12 
 
 
513 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1910  carboxypeptidase Taq  40.94 
 
 
505 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1280  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  40.28 
 
 
508 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0528  carboxypeptidase Taq  38.34 
 
 
491 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2306  carboxypeptidase Taq  41.86 
 
 
498 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  39.92 
 
 
500 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6897  Carboxypeptidase Taq  41.04 
 
 
505 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632166  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1901  Carboxypeptidase Taq  38.74 
 
 
500 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0115  carboxypeptidase Taq  40.21 
 
 
501 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0714794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0221  carboxypeptidase Taq  38.16 
 
 
499 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1511  carboxypeptidase Taq  41.7 
 
 
490 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0334  thermostable carboxypeptidase 1  43.06 
 
 
497 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000340844  normal  0.0241482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5282  Carboxypeptidase Taq  41.77 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1443  thermostable carboxypeptidase 1  36.42 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  37.74 
 
 
507 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0588  carboxypeptidase Taq  37.37 
 
 
490 aa  355  8.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.557389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1732  thermostable carboxypeptidase 1  36.67 
 
 
505 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00039237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1471  thermostable carboxypeptidase 1  36.42 
 
 
505 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1444  thermostable carboxypeptidase 1  36.42 
 
 
505 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1587  thermostable carboxypeptidase 1  36.42 
 
 
505 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2431  thermostable carboxypeptidase 1  40.37 
 
 
488 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123426  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1657  thermostable carboxypeptidase 1  36.42 
 
 
505 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.142902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1487  carboxypeptidase Taq  36.42 
 
 
505 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3535  Carboxypeptidase Taq  38.28 
 
 
524 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1693  thermostable carboxypeptidase 1  37.61 
 
 
505 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3724  thermostable carboxypeptidase 1  36.62 
 
 
505 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0790485  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1620  thermostable carboxypeptidase 1  36.62 
 
 
505 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.139745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3995  carboxypeptidase  37.7 
 
 
512 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1148  hypothetical protein  36.2 
 
 
493 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4120  thermostable carboxypeptidase 1  37.57 
 
 
509 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0349693  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2170  thermostable carboxypeptidase 1  40.21 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0129  carboxypeptidase Taq  40.93 
 
 
539 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391252  normal  0.815182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0281  Carboxypeptidase Taq  37.25 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.053767  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1152  hypothetical protein  35.64 
 
 
493 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3700  carboxypeptidase Taq  39.39 
 
 
490 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.812633  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1916  carboxypeptidase Taq  38.59 
 
 
494 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1538  Carboxypeptidase Taq  37 
 
 
525 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3813  hypothetical protein  38.2 
 
 
493 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0791369  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3525  carboxypeptidase Taq  38 
 
 
493 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  39.32 
 
 
497 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3832  carboxypeptidase  38 
 
 
493 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1143  carboxypeptidase Taq  37.55 
 
 
491 aa  330  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.880926  hitchhiker  0.0000000000114944 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0441  carboxypeptidase Taq  38.48 
 
 
497 aa  331  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  39.44 
 
 
491 aa  329  6e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1781  Zn-dependent carboxypeptidase  35.99 
 
 
496 aa  329  9e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0152  Carboxypeptidase Taq  37.07 
 
 
497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  38.23 
 
 
501 aa  327  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  38.03 
 
 
501 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2902  carboxypeptidase Taq  38.23 
 
 
501 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0104  carboxypeptidase Taq  37.42 
 
 
490 aa  325  9e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0916  carboxypeptidase Taq  38.76 
 
 
494 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1024  thermostable carboxypeptidase 1  37.23 
 
 
524 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1334  carboxypeptidase  36.69 
 
 
489 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45064  predicted protein  35.62 
 
 
582 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971363  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  37.63 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003628  thermostable carboxypeptidase 1  36.97 
 
 
490 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3255  carboxypeptidase Taq  38.22 
 
 
501 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29467  predicted protein  37.2 
 
 
514 aa  318  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000501593  normal  0.0333028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3112  carboxypeptidase Taq  38.61 
 
 
501 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.977178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6694  Carboxypeptidase Taq  38.37 
 
 
501 aa  317  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3102  carboxypeptidase Taq  38.02 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1034  carboxypeptidase Taq  36.62 
 
 
494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1800  carboxypeptidase  35.74 
 
 
494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1264  Carboxypeptidase Taq  37.5 
 
 
501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1537  Carboxypeptidase Taq  36.22 
 
 
509 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0425  Carboxypeptidase Taq  34.27 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0947  carboxypeptidase Taq  37.97 
 
 
499 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3558  Carboxypeptidase Taq  34.66 
 
 
493 aa  312  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.232538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1020  carboxypeptidase Taq  37.45 
 
 
496 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0861  hypothetical protein  34.62 
 
 
501 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1824  putative thermostable carboxypeptidase I  36.8 
 
 
499 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1935  carboxypeptidase Taq  36.8 
 
 
499 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0536  carboxypeptidase Taq  37.53 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2302  putative thermostable carboxypeptidase I  37.47 
 
 
499 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.834823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0344  carboxypeptidase Taq  37.2 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02477  carboxypeptidase  35.89 
 
 
490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4189  carboxypeptidase Taq  38.18 
 
 
502 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.443075  normal  0.317681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  38.61 
 
 
504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1082  carboxypeptidase Taq  35.89 
 
 
496 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864515  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0802  carboxypeptidase Taq  37.83 
 
 
493 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2751  carboxypeptidase Taq  36.25 
 
 
493 aa  299  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.671952  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3175  thermostable carboxypeptidase 1  36.31 
 
 
496 aa  299  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3232  thermostable carboxypeptidase 1  37.45 
 
 
512 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0847  Carboxypeptidase Taq  36.51 
 
 
467 aa  296  7e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0305  Carboxypeptidase Taq  37.1 
 
 
499 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.915505  normal  0.0332856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0351  Carboxypeptidase Taq  37.04 
 
 
498 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3640  peptidase M32 carboxypeptidase Taq metallopeptidase  37.83 
 
 
495 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2592  carboxypeptidase Taq  34.45 
 
 
498 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0759  carboxypeptidase Taq  33.66 
 
 
501 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00227829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>